Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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IRF3Q14653 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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IRF3Q14653 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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IRF3Q14653 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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IRF3Q14653 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
IRF3Q14653 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF3Q14653 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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