Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B2Q13435 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
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