Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 GCG1YER163C 699 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 RGD2YFL047W 2145 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 RPC17YJL011C 486 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YKL153WYKL153W 510 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YLR184WYLR184W 348 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YLR374CYLR374C 390 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 LSC1YOR142W 990 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 MPD1YOR288C 957 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 SLM5YCR024C 1479 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 DDC1YPL194W 1839 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 SLA2YNL243W 2907 nt6.45□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 PXL1YKR090W 2121 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 ECM38YLR299W 1983 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 PPH22YDL188C 1134 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 OM45YIL136W 1182 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YKR032WYKR032W 315 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YLR118CYLR118C 684 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 REX4YOL080C 870 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YBR113WYBR113W 483 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 APA1YCL050C 966 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 DOT1YDR440W 1749 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 DRN1YGR093W 1524 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 EDE1YBL047C 4146 nt6.44□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 HXT2YMR011W 1626 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 CYC8YBR112C 2901 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 DOS2YDR068W 933 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YDR290WYDR290W 330 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 HIS1YER055C 894 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 HSP12YFL014W 330 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 ACT1YFL039C 1128 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 DDI2YFL061W 678 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YIL152WYIL152W 708 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 RUF5-1RUF5-1 710 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 DDI3YNL335W 678 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 RUF5-2RUF5-2 710 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 MTF2YDL044C 1323 nt6.43□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 BDF2YDL070W 1917 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YDR415CYDR415C 1125 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YFL012WYFL012W 447 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 COS4YFL062W 1140 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 CIA2YHR122W 696 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 CTF8YHR191C 402 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 OPI8YKR035C 642 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 SIC1YLR079W 855 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 PRM9YAR031W 897 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YBL062WYBL062W 381 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YAP7YOL028C 738 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 BBP1YPL255W 1158 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 GRX1YCL035C 333 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YCL041CYCL041C 495 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 RNY1YPL123C 1305 nt6.42□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 ALT2YDR111C 1524 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 PBI1YPL272C 1554 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YJR146WYJR146W 354 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 MIA40YKL195W 1212 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YNL200CYNL200C 741 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 RPL5YPL131W 894 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 ILV6YCL009C 930 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 UTP7YER082C 1665 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 ARP3YJR065C 1350 nt6.41□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 AVT4YNL101W 2142 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 FAL1YDR021W 1200 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 CAD1YDR423C 1230 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 YGR219WYGR219W 342 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 LYS1YIR034C 1122 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 DRE2YKR071C 1047 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 COS3YML132W 1140 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 RUF20RUF20 443 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 TAF3YPL011C 1062 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 CBP6YBR120C 489 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 CSH1YBR161W 1131 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 COS2YBR302C 1140 nt6.4□□□□□ -1.38
MCD1Q12158 AVO1YOL078W 3531 nt6.4□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 BRL1YHR036W 1416 nt6.4□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 TRS23YDR246W 660 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 YDR445CYDR445C 408 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 YKL071WYKL071W 771 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 YKL077WYKL077W 1179 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 MID2YLR332W 1131 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 RPS10BYMR230W 318 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 MRPL23YOR150W 492 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 YPL257WYPL257W 582 nt6.39□□□□□ -1.39
MCD1Q12158 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.9 ms