Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN3Q08043 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms