Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF2Q03403 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFF2Q03403 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms