Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YLR463C	YLR463C	552 nt		5.36	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	YMR147W	YMR147W	672 nt		5.36	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	HLJ1	YMR161W	675 nt		5.36	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	ELC1	YPL046C	300 nt		5.36	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	NGR1	YBR212W	2019 nt		5.35	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	RCK1	YGL158W	1539 nt		5.35	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	UGA1	YGR019W	1416 nt		5.35	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	PRP46	YPL151C	1356 nt		5.35	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	PMP3	YDR276C	168 nt		5.35	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	SFK1	YKL051W	1062 nt		5.35	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	MPP10	YJR002W	1782 nt		5.34	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	TEF1	YPR080W	1377 nt		5.34	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	TEF2	YBR118W	1377 nt		5.34	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	YEA6	YEL006W	1008 nt		5.34	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	AST1	YBL069W	1290 nt		5.34	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	CPS1	YJL172W	1731 nt		5.34	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	GDB1	YPR184W	4611 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	APM2	YHL019C	1818 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	CDC4	YFL009W	2340 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	MTQ2	YDR140W	666 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	ZRT1	YGL255W	1131 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	RRP4	YHR069C	1080 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YLR157W-E	YLR157W-E	165 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YML131W	YML131W	1098 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	AAD15	YOL165C	432 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	GAL4	YPL248C	2646 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	FZO1	YBR179C	2568 nt		5.33	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	BSC5	YNR069C	1470 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	SMF3	YLR034C	1422 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	RPS16B	YDL083C	432 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	LUC7	YDL087C	786 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	SRN2	YLR119W	642 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	RSA3	YLR221C	663 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YBL044W	YBL044W	369 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YNL228W	YNL228W	777 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	CWC25	YNL245C	540 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	SIF2	YBR103W	1608 nt		5.32	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	HXT3	YDR345C	1704 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	SFI1	YLL003W	2841 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	GIP2	YER054C	1647 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	SEG2	YKL105C	3399 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	SEC13	YLR208W	894 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	CSR1	YLR380W	1227 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	MRPL24	YMR193W	777 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	DCI1	YOR180C	816 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	RDL1	YOR285W	420 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	UTP7	YER082C	1665 nt		5.31	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	TRK2	YKR050W	2670 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	PCA1	YBR295W	3651 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	RPN5	YDL147W	1338 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	SUM1	YDR310C	3189 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YCL065W	YCL065W	369 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	PEX7	YDR142C	1128 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	RPL12A	YEL054C	498 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YER187W	YER187W	426 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	STP4	YDL048C	1473 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	DOA1	YKL213C	2148 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YGR125W	YGR125W	3111 nt		5.3	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	ECM7	YLR443W	1347 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YIL092W	YIL092W	1902 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	GUS1	YGL245W	2127 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	HFI1	YPL254W	1467 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YRA1	YDR381W	681 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	MTW1	YAL034W-A	870 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	HEM15	YOR176W	1182 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YPR150W	YPR150W	522 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	KRS1	YDR037W	1776 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YTA12	YMR089C	2478 nt		5.29	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	VMA16	YHR026W	642 nt		5.28	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	ATG12	YBR217W	561 nt		5.28	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	APM1	YPL259C	1428 nt		5.28	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	CLB4	YLR210W	1383 nt		5.28	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	UGO1	YDR470C	1509 nt		5.28	□□□□□ -1.56
DSL1	P53847	YEF1	YEL041W	1488 nt		5.27	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	TPS3	YMR261C	3165 nt		5.27	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	QRI1	YDL103C	1434 nt		5.27	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	SRG1	SRG1	551 nt		5.27	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	YGR291C	YGR291C	222 nt		5.27	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		5.27	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	PTR2	YKR093W	1806 nt		5.27	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	SAP155	YFR040W	3009 nt		5.26	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		5.26	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	YDR541C	YDR541C	1035 nt		5.26	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MED4	YOR174W	855 nt		5.26	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	FRE1	YLR214W	2061 nt		5.26	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MRK1	YDL079C	1506 nt		5.26	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	SLT2	YHR030C	1455 nt		5.26	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	ACF2	YLR144C	2340 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	TDA7	YNL176C	1911 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	BRF1	YGR246C	1791 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	YGR016W	YGR016W	573 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MRS3	YJL133W	945 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MOG1	YJR074W	657 nt		5.25	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.8 ms