Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A3P53794 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A3P53794 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A3P53794 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A3P53794 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A3P53794 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC5A3P53794 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A3P53794 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms