Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3P51812 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA3P51812 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms