Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCAMP50895 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCAMP50895 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCAMP50895 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BCAMP50895 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCAMP50895 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCAMP50895 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCAMP50895 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAMP50895 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAMP50895 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAMP50895 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAMP50895 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAMP50895 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAMP50895 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAMP50895 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCAMP50895 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCAMP50895 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAMP50895 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAMP50895 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAMP50895 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAMP50895 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAMP50895 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAMP50895 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCAMP50895 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCAMP50895 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCAMP50895 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCAMP50895 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCAMP50895 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCAMP50895 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BCAMP50895 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAMP50895 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAMP50895 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
BCAMP50895 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAMP50895 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAMP50895 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAMP50895 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAMP50895 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAMP50895 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAMP50895 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAMP50895 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAMP50895 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAMP50895 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAMP50895 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAMP50895 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAMP50895 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAMP50895 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAMP50895 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCAMP50895 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCAMP50895 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAMP50895 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAMP50895 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAMP50895 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAMP50895 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAMP50895 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAMP50895 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAMP50895 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCAMP50895 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCAMP50895 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAMP50895 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAMP50895 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAMP50895 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAMP50895 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228 ms