Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD3P0DMS9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD3P0DMS9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms