Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06334 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06334 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06334 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06334 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06334 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06334 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06334 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06334 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06334 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06334 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06334 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06334 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06334 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06334 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06334 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06334 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06334 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06334 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms