Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A1P02462 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL4A1P02462 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A1P02462 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A1P02462 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A1P02462 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A1P02462 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A1P02462 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A1P02462 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A1P02462 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A1P02462 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms