Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN3BO60391 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN3BO60391 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms