Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1B2KF50 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms