Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNIH4Q9P003 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CNIH4Q9P003 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms