Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms