Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KATNB1Q9BVA0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms