Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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