Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms