Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFRP1Q8N474 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms