Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms