Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms