Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms