Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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