Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms