Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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