Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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