Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms