Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTBN1Q01082 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms