Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX1P78337 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX1P78337 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX1P78337 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX1P78337 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms