Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms