Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC11A1P49279 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms