Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NESP48681 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NESP48681 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NESP48681 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms