Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP4AP20648 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms