Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA1C9JL84 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms