Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRD1A4D1F6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms