Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIH9

KLF15, Krueppel-like factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF15Q9UIH9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF15Q9UIH9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF15Q9UIH9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms