Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms