Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf135Q5VTT2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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C9orf135Q5VTT2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf135Q5VTT2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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