Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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