Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms