Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms