Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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