Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SNTG1-202ENST00000518864 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms