Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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