Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 516.4 ms