Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CACNA1BQ00975 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms