Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANGAP1P46060 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms