Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HOXB4P17483 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms