Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRTO14522 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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